С 23 сентября Россия начала ограничивать импорт и транзит казахстанского зерна и ряда других сельскохозяйственных товаров, ссылаясь на фитосанитарные нарушения. Россельхознадзор объявил, что их системы автоматически блокируют выдачу фитосанитарных сертификатов на казахстанское зерно, томаты, перец и семена подсолнечника, необходимых для пересечения границы. Минсельхоз Казахстана потребовал у Россельхознадзора документы, подтверждающие наличие опасных карантинных объектов в казахстанском зерне, муке и других сельскохозяйственных товарах, в связи с которыми Россия ввела ограничения на их ввоз. Вице-министр сельского хозяйства Казахстана Ермек Кенжеханулы заявил, что Казахстан запросил акты о выявленных нарушениях и результатах лабораторных исследований для подтверждения фактов. Решение России вызвало обсуждения, учитывая предыдущий запрет Казахстана на российскую пшеницу с 21 августа. Казахстан ожидает рекордный урожай зерна в этом году, часть которого предназначена для экспорта. Некоторые аналитики полагают, что действия России могут быть ответом на запрет Казахстана.